自主招标和政府采购虽然都是采购商品或服务的方法，但在操作方式、参与主体和程序要求等方面存在着一些明显的区别。
首先，自主招标是指企事业单位自主进行的采购方式，其参与主体通常为企事业单位自身或受其委托的代理机构。而政府采购是指政府部门或其授权的机构以公共利益为目的进行的采购活动，其参与主体为政府机构及选定的供应商。
其次，自主招标的程序相对更加简单灵活。企事业单位可以根据自身需求制定采购计划和招标文件，并自主确定招标标准、条件和细则。在招标过程中，企事业单位可以自由选择供应商，并通过公开或邀请方式进行招标。而政府采购则需要按照相关法律法规进行，包括编制招标文件、公布招标公告、组织开标评标、签订合同等一系列程序。
此外，在资金来源上也存在差异。自主招标通常采用企事业单位自有资金进行采购，而政府采购则是使用政府财政拨款或专项资金进行采购。这意味着政府采购的资金更加公开透明，受到财政预算和审计监督的约束，减少了不正当利益的可能性。
总而言之，自主招标和政府采购在操作方式、参与主体和程序要求等方面存在明显区别。自主招标更加便捷灵活，适用于企事业单位自主进行采购；而政府采购更加规范严谨，以公共利益为导向，需要遵守一系列法律法规的规定。合理选择适合自身需求的采购方式，将有助于提高采购效率和节约采购成本。
